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Phenyx とは何か?

当社は、Swiss Institute of Bioinformatics をはじめとする、多くのプロテオミクス科学機関との緊密な協力関係を通じ、この分野の研究の現在の課題を分析し、予想される将来の研究用途にも十分対応できる次世代の MS プロテオミクス解析ソフトウェア Phenyx を開発しました。Phenyx は、さまざまなシステム環境で利用できるように設計されているため、これまでご利用のプラットフォームにも簡単にインテグレーションが可能です。

Phenyx は、マススペクトロメトリーのデータを用いて、タンパク質やペプチドの同定を行うためのソフトウェアです。 Phenyx は、スイス生物情報研究所(Swiss Institute of Bioinformatics SIB)との協力のもとに、GeneBio が開発した純確率/数学的理論に基づく柔軟なスコアリングシステム OLAV を搭載しています。Phenyx は、ハイスループットの解析に対応できるように予め設計されている他、多面的に結果評価ができる最新の機能を搭載しています。(Phenyx について、さらに詳しく知りたい方)

Phenyx のワークフローは?

Phenyxは、2つの主要な要素、Phenyx ClientおよびPhenyx Calculation Unitで構成されています。Phenyx Clientは、Webインターフェイス(Phenyx Web Interface、PWI)の形でご利用いただけます。Phenyx Calculation Unitは、SIBにある高速パブリック・サーバーにネットワークで接続して試用できる他、セキュリティーの心配のないお客様自身のサーバにインストールする方法のいずれかの形で提供されており、貴社のシステム環境やラボの環境に合わせてインテグレーションできます。

この2つのコンポーネントによる解析のフローは以下のようになります。

1)Phenyx Clientの利各種条件設定を利用して複数ピークリストを同時サブミッションします。 2)様々な結果表示ウィンドウを用いて、結果を視覚化し多面的な評価を行うことができます。 3)表示された結果に様々な微調整を与えマニュアルでバリデーションできる他、他の解析ソフトウェアの結果を取り込み、比較評価することができます。 4)解析結果は様々なフォーマットで出力できるため、システムの規模とコンポーネントの種類を問わず、既存の解析プラットフォームのコアエンジンとして利用することが可能になります。   さらに詳細は...



Phenyx のより詳細な紹介をムービーにまとめました。

Phenyx をご使用いただくために

まず、Phenyx Webインターフェイスを直接訪問してください.